堆肥的分解过程是微生物分解有机质的过程，堆肥腐熟的快慢，与微生物的活动密切相关。因此，要加速堆肥腐熟，首先就要控制微生物的活动。堆肥积制过程中，影响微生活动的主要因素有：
（1）水分。 堆肥内含水量是空盒子堆肥成败与否的首要条件，一般含水量为原材料的60%～75%，有利于植株茎秆的软化与菌体的生长、移动，进而使堆肥材料快速、均匀地腐熟。含水量60%～75%的简单测试方法为：紧捏堆肥材料时有少量水挤出，即表示含水量适宜。
（2）温度。大部分微生物活动的最适宜温度为50～60℃，积制堆肥时，保持55～65℃的温度约1周时间，促使高温性纤维素分解菌强烈分解有机质后，再维持40～50℃的中温期以促进氨化作用和养分释放。堆肥中温度调节可以通过添减含有较高文性纤维素分解菌的马粪、水及覆盖厚土等措施来调节。
（3）空气。保持适量的空气，有利于好气微生物的繁殖与活动，促进有机质分解。若通气不良，好气性微生物的活动会受到抑制，堆肥内温度不易升高，堆腐迟缓；若通气过旺，好气性微生物繁殖过快，有机质大量分解，腐殖质化系数低，氮素损失大。适宜的通气性可以通过控制材料内的水分、堆积松紧度以及设置通气沟或通气筒等方法调节。
（4）酸碱度。大多数微生物适合在ph6.4～8.1中性至微碱性环境下活动，堆肥是，由于有机质分解时产生一定数量的有机酸，致使堆肥内酸性增强。为降低酸度，保持微生物适宜的生长环境，堆制时加入相当于秸秆等原料的2%～3%的石灰，降低酸度，同时石灰还能破坏秸秆表面的蜡质，使之易于吸水软化，加速发酵。
（5）碳氮比（c/n）一般微生物分解有机质的适宜碳氮比为25：1，而日常应用的堆肥材料一般是碳氮比较大，生活与其中的微生物由于缺少氮素营养，生命活动不旺盛，分解作用缓慢；当碳氮比叫小时，有机原料又大量损失。因此，堆肥时应加入适量的人畜粪尿、无机氮肥或碳氮比小的绿肥等原料，调节出适宜的碳氮比。